Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms