Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcph1Q7TT79 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcph1Q7TT79 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms