Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo1Q7TT28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Rexo1Q7TT28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo1Q7TT28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo1Q7TT28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo1Q7TT28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms