Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf7ipQ7TT18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms