Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccp110Q7TSH4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccp110Q7TSH4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms