Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn1Q7TPR4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms