Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ9

Arrdc3, Arrestin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc3Q7TPQ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arrdc3Q7TPQ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arrdc3Q7TPQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Arrdc3Q7TPQ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arrdc3Q7TPQ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arrdc3Q7TPQ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arrdc3Q7TPQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arrdc3Q7TPQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms