Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sbno2Q7TNB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210 ms