Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms