Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r3cQ7TMB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppp1r3cQ7TMB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms