Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd2Q7JJ13 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms