Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms