Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usmg5Q78IK2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usmg5Q78IK2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms