Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Higd1cQ76I25 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms