Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpv1Q704Y3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms