Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ncapd3Q6ZQK0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ncapd3Q6ZQK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms