Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M2Q6W9L1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M2Q6W9L1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms