Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms