Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2eQ6VUP9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms