Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ift172Q6VH22 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift172Q6VH22 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms