Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms