Protein–RNA interactions for Protein: Q6TXD4

Dnmbp, Dynamin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DnmbpQ6TXD4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DnmbpQ6TXD4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DnmbpQ6TXD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DnmbpQ6TXD4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DnmbpQ6TXD4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms