Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja6Q6S5G4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms