Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bnip1Q6QD59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bnip1Q6QD59 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms