Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca4aQ6Q473 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca4aQ6Q473 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms