Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4Q6PHQ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4Q6PHQ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4Q6PHQ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms