Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Taf1cQ6PDZ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms