Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc2Q6PDG5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms