Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SvoplQ6PDF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SvoplQ6PDF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms