Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms