Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB66

Lrpprc, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrpprcQ6PB66 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LrpprcQ6PB66 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LrpprcQ6PB66 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LrpprcQ6PB66 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LrpprcQ6PB66 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
LrpprcQ6PB66 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
LrpprcQ6PB66 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
LrpprcQ6PB66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms