Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf2Q6P9P0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms