Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sik3Q6P4S6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sik3Q6P4S6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik3Q6P4S6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms