Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg2f1Q6P3A2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms