Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrimpolQ6P1E7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrimpolQ6P1E7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms