Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms