Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpdc1Q6NZK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ptpdc1Q6NZK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms