Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY15

Tsga10, Testis-specific gene 10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga10Q6NY15 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsga10Q6NY15 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsga10Q6NY15 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms