Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rprd2Q6NXI6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rprd2Q6NXI6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rprd2Q6NXI6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms