Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpbp1Q6NXH3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms