Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HelbQ6NVF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HelbQ6NVF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms