Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
2810408A11RikQ6NSU2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms