Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pdcd11Q6NS46 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdcd11Q6NS46 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdcd11Q6NS46 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms