Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms