Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atrnl1Q6A051 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Atrnl1Q6A051 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atrnl1Q6A051 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms