Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ltn1Q6A009 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms