Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ric1Q69ZJ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ric1Q69ZJ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ric1Q69ZJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms