Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc2Q69ZB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc2Q69ZB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms