Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf280dQ68FE8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms