Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno1Q689Z5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno1Q689Z5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms